Contabilidade para médicos PJ, consultórios e clínicas, sem burocracia

Contabilidade para médicos: o que muda quando você abre o CNPJ

A Contefy faz contabilidade para médicos e clínicas em todo o Brasil: apuração mensal, pró-labore, folha, nota fiscal, abertura do CNPJ e troca de contador. Tudo digital, com uma pessoa responsável pela sua conta e atendimento por WhatsApp.

Médico não pode ser MEI

Medicina é profissão regulamentada de natureza intelectual e está fora da lista de ocupações permitidas ao MEI. O caminho é abrir uma empresa comum, em geral uma Sociedade Limitada Unipessoal (SLU), que não exige sócio e protege o patrimônio pessoal.

O CNAE descreve a sua atividade e influencia o imposto. Para consultório e plantão, o mais comum é o 8630-5/03, atividade médica ambulatorial restrita a consultas. Clínicas com procedimentos cirúrgicos usam o 8630-5/01, e clínicas com exames, o 8630-5/02. Um código genérico pode travar o credenciamento em convênios e gerar ISS incorreto.

No Simples Nacional, o Fator R decide entre Anexo III e V

A medicina entra, por padrão, no Anexo V do Simples, que começa em 15,5%. Se a folha, incluindo o pró-labore com encargos, representar 28% ou mais da receita bruta dos últimos 12 meses, a atividade vai para o Anexo III, que começa em 6%.

Para o médico PJ sem funcionários, o pró-labore é a principal alavanca do Fator R. Existe um ponto em que aumentar o pró-labore para chegar aos 28% custa menos do que pagar o Anexo V.

Por isso, o valor do pró-labore não pode ser definido no chute. Essa conta muda a cada faixa de faturamento e é refeita quando a sua receita muda. Você pode simular antes na calculadora de Fator R do site.

Equiparação hospitalar no Lucro Presumido

No Lucro Presumido, a regra geral presume lucro de 32% da receita para serviços. A equiparação hospitalar reduz essa presunção para 8% no IRPJ e 12% na CSLL quando a clínica presta serviços de natureza hospitalar, como procedimentos, cirurgias e exames, é sociedade empresária e atende às normas da ANVISA.

Consulta simples e plantão puro não se enquadram. A análise é feita caso a caso, com base na atividade real e na estrutura da clínica.

Simples ou Lucro Presumido: a conta da contabilidade para médicos

No Simples, a carga começa em 6% no Anexo III com Fator R, ou em 15,5% no Anexo V. No Lucro Presumido, fica em torno de 13% a 16%, e pode cair para 11% a 13% em clínicas que se enquadram na equiparação hospitalar.

Consultório e plantonista com folha enxuta tendem ao Simples com Fator R. Clínicas com estrutura e procedimentos podem pagar menos no Presumido com equiparação. É uma conta, não uma regra.

Pró-labore, INSS e distribuição de lucros

O médico sócio precisa retirar pró-labore. Sobre ele incidem INSS de 11% e IR pela tabela progressiva. Em 2026, retiradas de até R$ 5 mil por mês ficam isentas de IR (Lei 15.270/2025). O restante pode sair como distribuição de lucros, isenta de IR, com retenção de 10% sobre valores acima de R$ 50 mil por mês por sócio.

A combinação entre pró-labore e lucros também alimenta o Fator R. Para ter um ponto de partida antes de conversar com a gente, use a calculadora de pró-labore do site.

Quem atendemos

• Médico plantonista, que presta serviço como PJ para hospitais e clínicas e quer sair da pessoa física.
• Médico com consultório, atendendo sozinho como SLU, com o Fator R calibrado a cada faixa de faturamento.
• Clínicas médicas com procedimentos ou exames, que podem avaliar a equiparação hospitalar no Lucro Presumido.
• Quem já tem empresa aberta e quer revisar o CNAE, o anexo, o pró-labore e o regime tributário.

Trocar de contador

Não depende de autorização do contador atual: os documentos são da sua empresa. Pedimos o material, conferimos o que está aberto e assumimos a partir da competência combinada. Se houver pendência, você sabe antes de assinar. A troca não tem custo e inclui a revisão do CNAE, do anexo e do regime.

Contabilidade para médicos em todo o Brasil

A Contefy é uma contabilidade online com sede em Curitiba e atende médicos em todo o país. A nossa atenção fica nas contas que decidem quanto você paga: o CNAE, o Fator R, o pró-labore e o regime tributário.

Alíquota, valor e prazo conferimos na fonte oficial no momento da orientação, porque esses números mudam.