Contabilidade para farmácias em 2026 envolve segregação de receitas, ICMS-ST, tributação monofásica de PIS/Cofins e controle de estoque. Em primeiro lugar, este guia mostra como a contabilidade para farmácias funciona na prática. Assim, o dono de farmácia ou drogaria consegue avaliar custo, regime e economia antes de contratar contador. Além disso, comparamos Simples Anexo I, Lucro Presumido e Lucro Real — os caminhos do varejo farmacêutico. Em síntese, é o roteiro completo para não pagar imposto a mais sobre medicamento.

Adiante, você verá como tratar o ICMS-ST, a tributação monofásica e a segregação de receitas no Simples. Por exemplo, mostramos por que medicamento monofásico não paga PIS e Cofins de novo na revenda. De fato, errar a segregação custa de 3% a 9% do faturamento por ano. Por outro lado, a contabilidade certa devolve esse dinheiro ao caixa. Portanto, vale ler até o checklist final.


Como funciona contabilidade para farmácias

Em primeiro lugar, a contabilidade para farmácias cuida de quatro frentes específicas. Por isso, o contador apura ICMS, segrega receitas no Simples, controla estoque e processa a folha. Além disso, integra a Sefaz (ICMS e ST), a Receita Federal (DAS, SPED, EFD-Contribuições) e a Prefeitura (NFS-e e ISS de serviços). Em geral, a rotina mensal inclui conferência de notas de entrada, segregação de monofásicos e fechamento fiscal.

Em seguida, a farmácia vende produtos com tratamento tributário diferente no mesmo balcão. Por isso, medicamento, perfumaria, higiene e genérico têm regras próprias de ICMS e PIS/Cofins. Inclusive, sem a segregação correta, a farmácia paga tributo sobre item que já foi tributado na indústria.


Regimes tributários para farmácias e drogarias

RegimeCarga aproximadaQuando faz sentido
Simples Nacional (Anexo I)4% a 11,6% + ICMS-STFaturamento até R$ 4,8 mi; maioria das drogarias
Lucro PresumidoVaria com ICMS e margemMargem alta, faturamento acima de R$ 4,8 mi
Lucro RealConforme resultadoGrandes redes, margem baixa ou prejuízo
MEINão permitidoComércio de medicamento exige RT — vedado

Em primeiro lugar, a farmácia NÃO pode ser MEI por exigir farmacêutico responsável e licença sanitária. Por isso, a escolha real fica entre Simples Anexo I, Lucro Presumido e Lucro Real. De fato, a maioria das drogarias se enquadra no Simples até R$ 4,8 milhões por ano. Inclusive, a economia depende da boa segregação de receitas monofásicas no PGDAS.


ICMS-ST e tributação monofásica na contabilidade para farmácias

Em primeiro lugar, a maioria dos medicamentos está sujeita à Substituição Tributária do ICMS. Por isso, o ICMS é recolhido lá atrás, pela indústria ou pelo distribuidor, e a farmácia não recolhe de novo na venda. Além disso, PIS e Cofins de medicamentos seguem o regime monofásico, conforme a Lei 10.147/2000.

TributoTratamento na farmáciaEfeito prático
ICMSSubstituição Tributária (ST)Recolhido na entrada; não recolhe na venda
PIS / CofinsMonofásico (alíquota zero na revenda)Não paga de novo sobre medicamento
DAS (Simples)Segrega receita monofásica e STReduz a alíquota efetiva da farmácia
ISSSó sobre serviços (aplicação, aferição)Quando há serviço farmacêutico cobrado

Em seguida, o contador precisa segregar essas receitas dentro do PGDAS-D todo mês. De fato, sem a segregação, a farmácia paga PIS, Cofins e ICMS já recolhidos — dinheiro jogado fora. Inclusive, essa é a maior fonte de economia da contabilidade para farmácias no Simples.


CNAEs adequados para farmácias e drogarias

CNAEDescriçãoQuando usar
4771-7/01Comércio varejista de produtos farmacêuticos, sem manipulaçãoPrincipal — drogaria comum
4771-7/02Comércio varejista de produtos farmacêuticos, com manipulaçãoFarmácia de manipulação
4771-7/03Comércio varejista de produtos farmacêuticos homeopáticosFarmácia homeopática
4772-5/00Comércio varejista de cosméticos e higiene pessoalPerfumaria e higiene como secundário
8690-9/01Atividades de práticas integrativas e complementaresServiços farmacêuticos clínicos

Em primeiro lugar, o CNAE principal define o Anexo do Simples e as obrigações sanitárias. Por isso, o 4771-7/01 cobre a drogaria que só revende. Inclusive, a farmácia de manipulação usa o 4771-7/02 e tem regras fiscais próprias por produzir a fórmula.


Licença sanitária, RT e SNGPC

Em primeiro lugar, toda farmácia precisa de licença sanitária e de farmacêutico responsável técnico (RT) registrado no CRF. Por isso, a Vigilância Sanitária fiscaliza o funcionamento e a guarda de medicamentos controlados. Além disso, o SNGPC (ANVISA) controla a entrada e a saída de produtos sob receita.


Quanto custa contabilidade para farmácias

Perfil da farmáciaHonorários (R$/mês)Pacote típico
Drogaria solo no Simples350 a 700DAS, segregação, folha, balanço
Drogaria com até 5 funcionários600 a 1.200DAS, folha, DCTFWeb, segregação, estoque
Farmácia de manipulação800 a 1.800DAS/SPED, controle de fórmulas, folha
Farmácia Lucro Presumido1.200 a 2.500DARFs, SPED Fiscal, EFD-Contribuições, ECF
Rede de farmácias (Lucro Real)3.000 a 8.000Apuração mensal, ICMS por loja, livros completos

Em primeiro lugar, a contabilidade para farmácias exige conhecimento de ICMS-ST, monofásico e segregação. Por isso, escolher um contador generalista quase sempre custa mais caro no fim. Inclusive, o contador especializado configura a segregação automática do PGDAS e devolve margem à farmácia.


Calendário mensal de obrigações da farmácia

ObrigaçãoPeriodicidadeVencimento típico
DAS (Simples Nacional)MensalDia 20
PGDAS-D com segregaçãoMensalJunto com a DAS
SPED Fiscal (Presumido/Real)MensalConforme o estado
EFD-Contribuições (Presumido/Real)MensalDia 10 do 2º mês seguinte
DCTFWebMensalDia 15
FGTSMensalDia 20
eSocial — eventos não periódicosPor eventoEm até 7 dias
SNGPC (ANVISA)Conforme movimentoPor dispensação de controlados
DEFIS (Simples)Anual31 de março
ECF / ECD (Presumido/Real)AnualJunho/Julho

Reforma Tributária — impacto para farmácias

Em primeiro lugar, a Reforma Tributária (LC 214/2025) substitui PIS, Cofins, ICMS e ISS por CBS e IBS. Por isso, o regime monofásico de medicamentos será revisto com regras específicas de crédito. Além disso, a transição vai de 2026 a 2032 com alíquotas crescentes.

Em seguida, medicamentos terão alíquota reduzida e lista de itens com benefício na LC 214/2025. De fato, a farmácia que organiza o cadastro de produtos hoje sofre menos na transição. Portanto, o contador especializado já mapeia o impacto por categoria de produto.


Erros comuns ao escolher contabilidade para farmácias


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Em seguida, vale ler nossos guias correlatos. Por exemplo, contabilidade para farmacêuticos trata do profissional, não do estabelecimento. Além disso, contabilidade para e-commerce ajuda quem também vende online. Inclusive, leia contabilidade online em todo Brasil para entender o atendimento remoto.


Checklist para contratar contabilidade para farmácias


Conclusão sobre contabilidade para farmácias

Em síntese, a contabilidade para farmácias em 2026 exige conhecimento técnico do varejo farmacêutico. Em primeiro lugar, a segregação de receitas monofásicas e ST define quanto a farmácia paga de imposto. Além disso, o cadastro correto de produtos por NCM evita ICMS-ST indevido. Por fim, o controle de estoque e o SNGPC protegem a empresa de autuação.

Por outro lado, errar qualquer item custa caro — tributo em duplicidade, estoque divergente ou multa da ANVISA. De fato, um contador especializado em farmácia paga a si mesmo já no primeiro mês. Portanto, vale priorizar especialização e SLA escrito na hora de contratar.

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